Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TMX3Q96JJ7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMX3Q96JJ7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMX3Q96JJ7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMX3Q96JJ7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMX3Q96JJ7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TMX3Q96JJ7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMX3Q96JJ7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMX3Q96JJ7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMX3Q96JJ7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMX3Q96JJ7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMX3Q96JJ7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMX3Q96JJ7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMX3Q96JJ7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TMX3Q96JJ7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMX3Q96JJ7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMX3Q96JJ7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMX3Q96JJ7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMX3Q96JJ7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMX3Q96JJ7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMX3Q96JJ7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMX3Q96JJ7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMX3Q96JJ7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TMX3Q96JJ7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMX3Q96JJ7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMX3Q96JJ7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMX3Q96JJ7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMX3Q96JJ7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms