Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRIG1Q96JA1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRIG1Q96JA1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRIG1Q96JA1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRIG1Q96JA1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms