Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPD52L3Q96J77 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPD52L3Q96J77 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPD52L3Q96J77 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms