Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP36Q96G28 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP36Q96G28 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP36Q96G28 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms