Protein–RNA interactions for Protein: Q96G25

MED8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED8Q96G25 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED8Q96G25 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
MED8Q96G25 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MED8Q96G25 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms