Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUB1Q96FW1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
OTUB1Q96FW1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms