Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CPNE2Q96FN4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CPNE2Q96FN4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms