Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX11Q96FC9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX11Q96FC9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX11Q96FC9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX11Q96FC9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX11Q96FC9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX11Q96FC9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX11Q96FC9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX11Q96FC9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX11Q96FC9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX11Q96FC9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX11Q96FC9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX11Q96FC9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX11Q96FC9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX11Q96FC9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX11Q96FC9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX11Q96FC9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX11Q96FC9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX11Q96FC9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX11Q96FC9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX11Q96FC9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX11Q96FC9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX11Q96FC9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX11Q96FC9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX11Q96FC9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
DDX11Q96FC9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX11Q96FC9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms