Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MVB12AQ96EY5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MVB12AQ96EY5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MVB12AQ96EY5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms