Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC127Q96BQ5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC127Q96BQ5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC127Q96BQ5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms