Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRIM52Q96A61 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRIM52Q96A61 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRIM52Q96A61 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRIM52Q96A61 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRIM52Q96A61 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRIM52Q96A61 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRIM52Q96A61 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms