Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP2A3Q93084 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2A3Q93084 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP2A3Q93084 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP2A3Q93084 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms