Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNPO1Q92973 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TNPO1Q92973 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms