Protein–RNA interactions for Protein: Q92858

ATOH1, Protein atonal homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATOH1Q92858 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATOH1Q92858 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATOH1Q92858 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATOH1Q92858 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATOH1Q92858 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATOH1Q92858 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATOH1Q92858 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATOH1Q92858 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATOH1Q92858 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATOH1Q92858 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATOH1Q92858 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATOH1Q92858 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATOH1Q92858 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATOH1Q92858 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATOH1Q92858 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATOH1Q92858 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATOH1Q92858 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATOH1Q92858 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATOH1Q92858 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATOH1Q92858 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATOH1Q92858 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATOH1Q92858 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATOH1Q92858 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATOH1Q92858 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms