Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PROX1Q92786 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PROX1Q92786 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms