Protein–RNA interactions for Protein: Q92753

RORB, Nuclear receptor ROR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORBQ92753 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RORBQ92753 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RORBQ92753 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORBQ92753 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORBQ92753 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORBQ92753 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORBQ92753 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORBQ92753 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORBQ92753 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORBQ92753 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORBQ92753 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORBQ92753 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORBQ92753 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORBQ92753 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORBQ92753 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORBQ92753 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORBQ92753 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RORBQ92753 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RORBQ92753 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RORBQ92753 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RORBQ92753 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RORBQ92753 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RORBQ92753 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RORBQ92753 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RORBQ92753 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RORBQ92753 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RORBQ92753 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RORBQ92753 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RORBQ92753 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RORBQ92753 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RORBQ92753 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RORBQ92753 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RORBQ92753 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RORBQ92753 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RORBQ92753 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RORBQ92753 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RORBQ92753 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RORBQ92753 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RORBQ92753 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RORBQ92753 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RORBQ92753 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RORBQ92753 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RORBQ92753 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RORBQ92753 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RORBQ92753 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RORBQ92753 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RORBQ92753 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RORBQ92753 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RORBQ92753 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RORBQ92753 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RORBQ92753 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RORBQ92753 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RORBQ92753 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RORBQ92753 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RORBQ92753 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RORBQ92753 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RORBQ92753 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RORBQ92753 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RORBQ92753 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RORBQ92753 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RORBQ92753 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RORBQ92753 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RORBQ92753 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RORBQ92753 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RORBQ92753 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RORBQ92753 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RORBQ92753 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RORBQ92753 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORBQ92753 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORBQ92753 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORBQ92753 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORBQ92753 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORBQ92753 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORBQ92753 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORBQ92753 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORBQ92753 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORBQ92753 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORBQ92753 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORBQ92753 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORBQ92753 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORBQ92753 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORBQ92753 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORBQ92753 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORBQ92753 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORBQ92753 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORBQ92753 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RORBQ92753 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RORBQ92753 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RORBQ92753 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RORBQ92753 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RORBQ92753 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RORBQ92753 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RORBQ92753 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RORBQ92753 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RORBQ92753 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RORBQ92753 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RORBQ92753 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RORBQ92753 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RORBQ92753 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RORBQ92753 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms