Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PTPRUQ92729 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRUQ92729 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRUQ92729 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRUQ92729 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PTPRUQ92729 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PTPRUQ92729 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRUQ92729 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PTPRUQ92729 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PTPRUQ92729 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
PTPRUQ92729 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRUQ92729 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRUQ92729 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRUQ92729 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRUQ92729 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRUQ92729 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRUQ92729 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.78■■■■□ 3
PTPRUQ92729 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRUQ92729 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PTPRUQ92729 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRUQ92729 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PTPRUQ92729 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTPRUQ92729 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRUQ92729 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRUQ92729 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRUQ92729 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRUQ92729 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRUQ92729 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRUQ92729 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRUQ92729 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRUQ92729 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRUQ92729 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRUQ92729 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRUQ92729 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRUQ92729 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRUQ92729 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRUQ92729 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRUQ92729 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRUQ92729 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTPRUQ92729 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTPRUQ92729 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPRUQ92729 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPRUQ92729 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms