Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RABGGTAQ92696 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RABGGTAQ92696 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RABGGTAQ92696 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RABGGTAQ92696 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
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