Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SSC4DQ8WTU2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSC4DQ8WTU2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSC4DQ8WTU2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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