Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE85

GRHL3, Grainyhead-like protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL3Q8TE85 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GRHL3Q8TE85 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRHL3Q8TE85 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms