Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CSNK2A3Q8NEV1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSNK2A3Q8NEV1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSNK2A3Q8NEV1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms