Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TTC29Q8NA56 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTC29Q8NA56 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC29Q8NA56 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms