Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SAMD12Q8N8I0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD12Q8N8I0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms