Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC155Q8N6L0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC155Q8N6L0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC155Q8N6L0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC155Q8N6L0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms