Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHCHD4Q8N4Q1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CHCHD4Q8N4Q1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
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