Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FBXO39Q8N4B4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO39Q8N4B4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO39Q8N4B4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms