Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NME8Q8N427 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NME8Q8N427 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NME8Q8N427 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NME8Q8N427 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NME8Q8N427 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NME8Q8N427 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NME8Q8N427 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NME8Q8N427 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NME8Q8N427 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NME8Q8N427 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NME8Q8N427 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NME8Q8N427 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NME8Q8N427 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NME8Q8N427 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NME8Q8N427 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NME8Q8N427 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NME8Q8N427 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NME8Q8N427 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NME8Q8N427 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NME8Q8N427 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NME8Q8N427 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NME8Q8N427 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NME8Q8N427 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NME8Q8N427 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NME8Q8N427 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms