Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STAG2Q8N3U4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.54■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.52■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
STAG2Q8N3U4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
STAG2Q8N3U4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms