Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMYD4Q8IYR2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMYD4Q8IYR2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMYD4Q8IYR2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMYD4Q8IYR2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms