Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC117Q8IWD4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC117Q8IWD4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC117Q8IWD4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms