Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW00

VSTM4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4Q8IW00 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VSTM4Q8IW00 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
VSTM4Q8IW00 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VSTM4Q8IW00 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms