Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMPRSS6Q8IU80 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMPRSS6Q8IU80 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMPRSS6Q8IU80 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms