Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HAPLN4Q86UW8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HAPLN4Q86UW8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms