Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01551Q86U37 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC01551Q86U37 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01551Q86U37 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms