Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU7

SETD3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD3Q86TU7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD3Q86TU7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETD3Q86TU7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD3Q86TU7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD3Q86TU7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD3Q86TU7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD3Q86TU7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD3Q86TU7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD3Q86TU7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETD3Q86TU7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SETD3Q86TU7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SETD3Q86TU7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SETD3Q86TU7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms