Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLNKQ7Z7G1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLNKQ7Z7G1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLNKQ7Z7G1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms