Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC46A3Q7Z3Q1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC46A3Q7Z3Q1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC46A3Q7Z3Q1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC46A3Q7Z3Q1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC46A3Q7Z3Q1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC46A3Q7Z3Q1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC46A3Q7Z3Q1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC46A3Q7Z3Q1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC46A3Q7Z3Q1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC46A3Q7Z3Q1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC46A3Q7Z3Q1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC46A3Q7Z3Q1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC46A3Q7Z3Q1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC46A3Q7Z3Q1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC46A3Q7Z3Q1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC46A3Q7Z3Q1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC46A3Q7Z3Q1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC46A3Q7Z3Q1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC46A3Q7Z3Q1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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