Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATG9AQ7Z3C6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATG9AQ7Z3C6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ATG9AQ7Z3C6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATG9AQ7Z3C6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms