Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT6

SSX6, Putative protein SSX6, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX6Q7RTT6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSX6Q7RTT6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSX6Q7RTT6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSX6Q7RTT6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms