Protein–RNA interactions for Protein: Q7M4L6

SHF, SH2 domain-containing adapter protein F, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHFQ7M4L6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SHFQ7M4L6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SHFQ7M4L6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SHFQ7M4L6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHFQ7M4L6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHFQ7M4L6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHFQ7M4L6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHFQ7M4L6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHFQ7M4L6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHFQ7M4L6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHFQ7M4L6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHFQ7M4L6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHFQ7M4L6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SHFQ7M4L6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHFQ7M4L6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHFQ7M4L6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHFQ7M4L6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHFQ7M4L6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHFQ7M4L6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHFQ7M4L6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHFQ7M4L6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHFQ7M4L6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHFQ7M4L6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SHFQ7M4L6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHFQ7M4L6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SHFQ7M4L6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms