Protein–RNA interactions for Protein: Q7L4E1

MIGA2, Mitoguardin 2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIGA2Q7L4E1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MIGA2Q7L4E1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MIGA2Q7L4E1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MIGA2Q7L4E1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MIGA2Q7L4E1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MIGA2Q7L4E1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MIGA2Q7L4E1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MIGA2Q7L4E1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MIGA2Q7L4E1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MIGA2Q7L4E1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MIGA2Q7L4E1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MIGA2Q7L4E1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MIGA2Q7L4E1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms