Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC149Q6ZUS6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC149Q6ZUS6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC149Q6ZUS6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC149Q6ZUS6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms