Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPN12Q6ZSI9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN12Q6ZSI9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN12Q6ZSI9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms