Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMC5Q6UXY8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMC5Q6UXY8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC5Q6UXY8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms