Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATRAIDQ6UW56 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATRAIDQ6UW56 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATRAIDQ6UW56 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms