Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.51■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
EDC4Q6P2E9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
EDC4Q6P2E9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
EDC4Q6P2E9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
EDC4Q6P2E9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
EDC4Q6P2E9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
EDC4Q6P2E9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
EDC4Q6P2E9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
EDC4Q6P2E9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
EDC4Q6P2E9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
EDC4Q6P2E9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
EDC4Q6P2E9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
EDC4Q6P2E9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.5 ms