Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDC42EP5Q6NZY7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDC42EP5Q6NZY7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDC42EP5Q6NZY7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDC42EP5Q6NZY7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms