Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REEP3Q6NUK4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REEP3Q6NUK4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP3Q6NUK4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms