Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NANOGP8Q6NSW7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NANOGP8Q6NSW7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms