Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SUMO4Q6EEV6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SUMO4Q6EEV6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SUMO4Q6EEV6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SUMO4Q6EEV6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUMO4Q6EEV6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUMO4Q6EEV6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUMO4Q6EEV6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUMO4Q6EEV6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUMO4Q6EEV6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUMO4Q6EEV6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUMO4Q6EEV6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUMO4Q6EEV6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUMO4Q6EEV6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SUMO4Q6EEV6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 367.8 ms